Protein–RNA interactions for Protein: P55284

Cdh5, Cadherin-5, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh5P55284 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh5P55284 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms