Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sftpa1P35242 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms