Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRGP23470 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms