Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

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Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk1P22518 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk1P22518 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Clk1P22518 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Clk1P22518 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Clk1P22518 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Clk1P22518 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Clk1P22518 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk1P22518 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Clk1P22518 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Clk1P22518 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Clk1P22518 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk1P22518 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk1P22518 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Clk1P22518 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk1P22518 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk1P22518 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk1P22518 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clk1P22518 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clk1P22518 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clk1P22518 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clk1P22518 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clk1P22518 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clk1P22518 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clk1P22518 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clk1P22518 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clk1P22518 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clk1P22518 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clk1P22518 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Clk1P22518 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clk1P22518 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clk1P22518 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clk1P22518 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clk1P22518 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clk1P22518 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clk1P22518 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clk1P22518 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clk1P22518 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clk1P22518 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clk1P22518 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clk1P22518 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clk1P22518 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clk1P22518 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clk1P22518 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clk1P22518 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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