Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

Predictions only

Length 2,300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprqP0C5E4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
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PtprqP0C5E4 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprqP0C5E4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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PtprqP0C5E4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprqP0C5E4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprqP0C5E4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprqP0C5E4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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PtprqP0C5E4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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PtprqP0C5E4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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PtprqP0C5E4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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PtprqP0C5E4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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PtprqP0C5E4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprqP0C5E4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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PtprqP0C5E4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprqP0C5E4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprqP0C5E4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprqP0C5E4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprqP0C5E4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprqP0C5E4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprqP0C5E4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprqP0C5E4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprqP0C5E4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprqP0C5E4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprqP0C5E4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprqP0C5E4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprqP0C5E4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprqP0C5E4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprqP0C5E4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprqP0C5E4 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprqP0C5E4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
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