Protein–RNA interactions for Protein: O88696

Clpp, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClppO88696 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClppO88696 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClppO88696 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClppO88696 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClppO88696 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClppO88696 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClppO88696 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClppO88696 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClppO88696 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ClppO88696 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClppO88696 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClppO88696 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClppO88696 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClppO88696 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClppO88696 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClppO88696 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClppO88696 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClppO88696 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClppO88696 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClppO88696 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClppO88696 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClppO88696 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClppO88696 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClppO88696 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClppO88696 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClppO88696 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClppO88696 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClppO88696 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClppO88696 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClppO88696 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ClppO88696 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClppO88696 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ClppO88696 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClppO88696 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClppO88696 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClppO88696 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClppO88696 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClppO88696 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClppO88696 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClppO88696 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClppO88696 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClppO88696 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClppO88696 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClppO88696 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ClppO88696 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ClppO88696 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ClppO88696 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ClppO88696 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ClppO88696 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ClppO88696 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ClppO88696 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClppO88696 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClppO88696 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClppO88696 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClppO88696 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClppO88696 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClppO88696 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClppO88696 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClppO88696 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClppO88696 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClppO88696 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClppO88696 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClppO88696 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClppO88696 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClppO88696 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClppO88696 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClppO88696 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClppO88696 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClppO88696 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClppO88696 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClppO88696 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClppO88696 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClppO88696 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClppO88696 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClppO88696 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClppO88696 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClppO88696 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ClppO88696 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ClppO88696 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClppO88696 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClppO88696 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClppO88696 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ClppO88696 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClppO88696 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClppO88696 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClppO88696 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClppO88696 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClppO88696 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClppO88696 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClppO88696 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClppO88696 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClppO88696 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClppO88696 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClppO88696 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClppO88696 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClppO88696 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClppO88696 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClppO88696 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClppO88696 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClppO88696 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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