Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Nedd9O35177 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nedd9O35177 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nedd9O35177 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nedd9O35177 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nedd9O35177 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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Nedd9O35177 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nedd9O35177 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Nedd9O35177 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nedd9O35177 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nedd9O35177 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nedd9O35177 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nedd9O35177 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nedd9O35177 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nedd9O35177 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Nedd9O35177 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nedd9O35177 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Nedd9O35177 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nedd9O35177 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Nedd9O35177 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Nedd9O35177 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nedd9O35177 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nedd9O35177 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Nedd9O35177 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nedd9O35177 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nedd9O35177 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Nedd9O35177 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nedd9O35177 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Nedd9O35177 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
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