Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim55G3X8Y1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim55G3X8Y1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim55G3X8Y1 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim55G3X8Y1 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim55G3X8Y1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim55G3X8Y1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim55G3X8Y1 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim55G3X8Y1 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim55G3X8Y1 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim55G3X8Y1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim55G3X8Y1 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim55G3X8Y1 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim55G3X8Y1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim55G3X8Y1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim55G3X8Y1 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim55G3X8Y1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim55G3X8Y1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim55G3X8Y1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim55G3X8Y1 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim55G3X8Y1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim55G3X8Y1 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim55G3X8Y1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim55G3X8Y1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim55G3X8Y1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim55G3X8Y1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim55G3X8Y1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim55G3X8Y1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim55G3X8Y1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim55G3X8Y1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim55G3X8Y1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim55G3X8Y1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms