Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmf1B9EKI3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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