Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms