Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
SNX13Q9Y5W8 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
SNX13Q9Y5W8 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SNX13Q9Y5W8 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SNX13Q9Y5W8 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SNX13Q9Y5W8 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SNX13Q9Y5W8 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SNX13Q9Y5W8 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SNX13Q9Y5W8 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SNX13Q9Y5W8 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SNX13Q9Y5W8 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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SNX13Q9Y5W8 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SNX13Q9Y5W8 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SNX13Q9Y5W8 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SNX13Q9Y5W8 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SNX13Q9Y5W8 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SNX13Q9Y5W8 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SNX13Q9Y5W8 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SNX13Q9Y5W8 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SNX13Q9Y5W8 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SNX13Q9Y5W8 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SNX13Q9Y5W8 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNX13Q9Y5W8 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNX13Q9Y5W8 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNX13Q9Y5W8 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNX13Q9Y5W8 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNX13Q9Y5W8 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNX13Q9Y5W8 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNX13Q9Y5W8 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNX13Q9Y5W8 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNX13Q9Y5W8 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNX13Q9Y5W8 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SNX13Q9Y5W8 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNX13Q9Y5W8 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNX13Q9Y5W8 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNX13Q9Y5W8 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNX13Q9Y5W8 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SNX13Q9Y5W8 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SNX13Q9Y5W8 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SNX13Q9Y5W8 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SNX13Q9Y5W8 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
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SNX13Q9Y5W8 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
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SNX13Q9Y5W8 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SNX13Q9Y5W8 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SNX13Q9Y5W8 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
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SNX13Q9Y5W8 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SNX13Q9Y5W8 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SNX13Q9Y5W8 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
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SNX13Q9Y5W8 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SNX13Q9Y5W8 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SNX13Q9Y5W8 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SNX13Q9Y5W8 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
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SNX13Q9Y5W8 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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SNX13Q9Y5W8 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SNX13Q9Y5W8 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SNX13Q9Y5W8 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SNX13Q9Y5W8 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SNX13Q9Y5W8 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SNX13Q9Y5W8 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SNX13Q9Y5W8 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SNX13Q9Y5W8 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SNX13Q9Y5W8 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SNX13Q9Y5W8 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SNX13Q9Y5W8 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SNX13Q9Y5W8 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SNX13Q9Y5W8 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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