Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
USP18Q9UMW8 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
USP18Q9UMW8 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
USP18Q9UMW8 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
USP18Q9UMW8 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
USP18Q9UMW8 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
USP18Q9UMW8 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
USP18Q9UMW8 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
USP18Q9UMW8 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
USP18Q9UMW8 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
USP18Q9UMW8 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
USP18Q9UMW8 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
USP18Q9UMW8 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
USP18Q9UMW8 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
USP18Q9UMW8 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
USP18Q9UMW8 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
USP18Q9UMW8 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
USP18Q9UMW8 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
USP18Q9UMW8 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
USP18Q9UMW8 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
USP18Q9UMW8 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
USP18Q9UMW8 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
USP18Q9UMW8 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
USP18Q9UMW8 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
USP18Q9UMW8 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
USP18Q9UMW8 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
USP18Q9UMW8 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
USP18Q9UMW8 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
USP18Q9UMW8 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
USP18Q9UMW8 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
USP18Q9UMW8 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
USP18Q9UMW8 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
USP18Q9UMW8 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
USP18Q9UMW8 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
USP18Q9UMW8 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
USP18Q9UMW8 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
USP18Q9UMW8 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
USP18Q9UMW8 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
USP18Q9UMW8 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
USP18Q9UMW8 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
USP18Q9UMW8 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
USP18Q9UMW8 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
USP18Q9UMW8 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
USP18Q9UMW8 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
USP18Q9UMW8 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
USP18Q9UMW8 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
USP18Q9UMW8 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
USP18Q9UMW8 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
USP18Q9UMW8 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
USP18Q9UMW8 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.66□□□□□ -2.14
USP18Q9UMW8 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
USP18Q9UMW8 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
USP18Q9UMW8 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
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USP18Q9UMW8 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
USP18Q9UMW8 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
USP18Q9UMW8 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
USP18Q9UMW8 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
USP18Q9UMW8 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
USP18Q9UMW8 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
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USP18Q9UMW8 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
USP18Q9UMW8 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
USP18Q9UMW8 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
USP18Q9UMW8 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
USP18Q9UMW8 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
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USP18Q9UMW8 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
USP18Q9UMW8 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
USP18Q9UMW8 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
USP18Q9UMW8 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
USP18Q9UMW8 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
USP18Q9UMW8 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
USP18Q9UMW8 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
USP18Q9UMW8 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
USP18Q9UMW8 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
USP18Q9UMW8 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
USP18Q9UMW8 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
USP18Q9UMW8 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
USP18Q9UMW8 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
USP18Q9UMW8 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
USP18Q9UMW8 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
USP18Q9UMW8 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
USP18Q9UMW8 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
USP18Q9UMW8 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
USP18Q9UMW8 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
USP18Q9UMW8 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
USP18Q9UMW8 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
USP18Q9UMW8 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
USP18Q9UMW8 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
USP18Q9UMW8 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
USP18Q9UMW8 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
USP18Q9UMW8 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
USP18Q9UMW8 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
USP18Q9UMW8 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
USP18Q9UMW8 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
USP18Q9UMW8 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
USP18Q9UMW8 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
USP18Q9UMW8 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
USP18Q9UMW8 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
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