Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
VAX2Q9UIW0 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.4 ms