Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
TIMMDC1Q9NPL8 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
TIMMDC1Q9NPL8 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
TIMMDC1Q9NPL8 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
TIMMDC1Q9NPL8 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
TIMMDC1Q9NPL8 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TIMMDC1Q9NPL8 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TIMMDC1Q9NPL8 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TIMMDC1Q9NPL8 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TIMMDC1Q9NPL8 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TIMMDC1Q9NPL8 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TIMMDC1Q9NPL8 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TIMMDC1Q9NPL8 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TIMMDC1Q9NPL8 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
TIMMDC1Q9NPL8 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
TIMMDC1Q9NPL8 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TIMMDC1Q9NPL8 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TIMMDC1Q9NPL8 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TIMMDC1Q9NPL8 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TIMMDC1Q9NPL8 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TIMMDC1Q9NPL8 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TIMMDC1Q9NPL8 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TIMMDC1Q9NPL8 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TIMMDC1Q9NPL8 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TIMMDC1Q9NPL8 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TIMMDC1Q9NPL8 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TIMMDC1Q9NPL8 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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