Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

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Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.15□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.14□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.13□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
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