Protein–RNA interactions for Protein: Q70JA7

CHSY3, Chondroitin sulfate synthase 3, humanhuman

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Length 882 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHSY3Q70JA7 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHSY3Q70JA7 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHSY3Q70JA7 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHSY3Q70JA7 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHSY3Q70JA7 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CHSY3Q70JA7 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHSY3Q70JA7 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHSY3Q70JA7 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHSY3Q70JA7 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHSY3Q70JA7 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHSY3Q70JA7 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHSY3Q70JA7 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHSY3Q70JA7 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CHSY3Q70JA7 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CHSY3Q70JA7 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CHSY3Q70JA7 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHSY3Q70JA7 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHSY3Q70JA7 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHSY3Q70JA7 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHSY3Q70JA7 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHSY3Q70JA7 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHSY3Q70JA7 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHSY3Q70JA7 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHSY3Q70JA7 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHSY3Q70JA7 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHSY3Q70JA7 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHSY3Q70JA7 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CHSY3Q70JA7 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CHSY3Q70JA7 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CHSY3Q70JA7 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CHSY3Q70JA7 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CHSY3Q70JA7 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHSY3Q70JA7 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHSY3Q70JA7 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHSY3Q70JA7 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHSY3Q70JA7 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHSY3Q70JA7 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHSY3Q70JA7 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHSY3Q70JA7 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHSY3Q70JA7 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHSY3Q70JA7 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHSY3Q70JA7 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CHSY3Q70JA7 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CHSY3Q70JA7 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHSY3Q70JA7 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHSY3Q70JA7 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHSY3Q70JA7 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHSY3Q70JA7 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHSY3Q70JA7 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHSY3Q70JA7 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHSY3Q70JA7 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHSY3Q70JA7 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHSY3Q70JA7 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CHSY3Q70JA7 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
CHSY3Q70JA7 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CHSY3Q70JA7 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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CHSY3Q70JA7 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CHSY3Q70JA7 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CHSY3Q70JA7 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CHSY3Q70JA7 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CHSY3Q70JA7 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CHSY3Q70JA7 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CHSY3Q70JA7 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CHSY3Q70JA7 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CHSY3Q70JA7 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHSY3Q70JA7 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHSY3Q70JA7 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHSY3Q70JA7 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHSY3Q70JA7 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHSY3Q70JA7 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHSY3Q70JA7 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHSY3Q70JA7 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHSY3Q70JA7 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHSY3Q70JA7 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHSY3Q70JA7 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHSY3Q70JA7 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHSY3Q70JA7 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHSY3Q70JA7 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHSY3Q70JA7 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHSY3Q70JA7 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHSY3Q70JA7 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHSY3Q70JA7 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
CHSY3Q70JA7 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHSY3Q70JA7 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHSY3Q70JA7 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHSY3Q70JA7 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHSY3Q70JA7 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHSY3Q70JA7 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHSY3Q70JA7 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHSY3Q70JA7 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHSY3Q70JA7 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CHSY3Q70JA7 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHSY3Q70JA7 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHSY3Q70JA7 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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CHSY3Q70JA7 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHSY3Q70JA7 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHSY3Q70JA7 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHSY3Q70JA7 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
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