Protein–RNA interactions for Protein: Q69YZ2

TMEM200B, Transmembrane protein 200B, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200BQ69YZ2 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
TMEM200BQ69YZ2 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TMEM200BQ69YZ2 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TMEM200BQ69YZ2 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TMEM200BQ69YZ2 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
TMEM200BQ69YZ2 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TMEM200BQ69YZ2 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TMEM200BQ69YZ2 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TMEM200BQ69YZ2 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
TMEM200BQ69YZ2 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TMEM200BQ69YZ2 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TMEM200BQ69YZ2 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
TMEM200BQ69YZ2 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
TMEM200BQ69YZ2 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.65□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TMEM200BQ69YZ2 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.6 ms