Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ANKRD39Q53RE8 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ANKRD39Q53RE8 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ANKRD39Q53RE8 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ANKRD39Q53RE8 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ANKRD39Q53RE8 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ANKRD39Q53RE8 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ANKRD39Q53RE8 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ANKRD39Q53RE8 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ANKRD39Q53RE8 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ANKRD39Q53RE8 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ANKRD39Q53RE8 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ANKRD39Q53RE8 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ANKRD39Q53RE8 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ANKRD39Q53RE8 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ANKRD39Q53RE8 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ANKRD39Q53RE8 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ANKRD39Q53RE8 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ANKRD39Q53RE8 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ANKRD39Q53RE8 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ANKRD39Q53RE8 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
ANKRD39Q53RE8 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ANKRD39Q53RE8 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 190.5 ms