Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CDO1Q16878 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CDO1Q16878 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CDO1Q16878 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CDO1Q16878 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CDO1Q16878 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CDO1Q16878 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CDO1Q16878 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CDO1Q16878 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CDO1Q16878 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CDO1Q16878 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
CDO1Q16878 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CDO1Q16878 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CDO1Q16878 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CDO1Q16878 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CDO1Q16878 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CDO1Q16878 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CDO1Q16878 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CDO1Q16878 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CDO1Q16878 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CDO1Q16878 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CDO1Q16878 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CDO1Q16878 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CDO1Q16878 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CDO1Q16878 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CDO1Q16878 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CDO1Q16878 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CDO1Q16878 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CDO1Q16878 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CDO1Q16878 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CDO1Q16878 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CDO1Q16878 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CDO1Q16878 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CDO1Q16878 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CDO1Q16878 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CDO1Q16878 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CDO1Q16878 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CDO1Q16878 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CDO1Q16878 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CDO1Q16878 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CDO1Q16878 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CDO1Q16878 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CDO1Q16878 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CDO1Q16878 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CDO1Q16878 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CDO1Q16878 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CDO1Q16878 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CDO1Q16878 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CDO1Q16878 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.34□□□□□ -2.36
CDO1Q16878 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CDO1Q16878 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CDO1Q16878 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CDO1Q16878 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CDO1Q16878 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CDO1Q16878 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CDO1Q16878 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CDO1Q16878 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CDO1Q16878 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CDO1Q16878 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CDO1Q16878 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CDO1Q16878 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CDO1Q16878 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CDO1Q16878 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CDO1Q16878 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CDO1Q16878 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CDO1Q16878 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CDO1Q16878 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CDO1Q16878 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CDO1Q16878 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
CDO1Q16878 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CDO1Q16878 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CDO1Q16878 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CDO1Q16878 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CDO1Q16878 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CDO1Q16878 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CDO1Q16878 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CDO1Q16878 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CDO1Q16878 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
CDO1Q16878 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CDO1Q16878 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CDO1Q16878 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CDO1Q16878 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CDO1Q16878 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CDO1Q16878 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CDO1Q16878 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CDO1Q16878 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.3□□□□□ -2.36
CDO1Q16878 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CDO1Q16878 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CDO1Q16878 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
CDO1Q16878 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.3□□□□□ -2.36
CDO1Q16878 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CDO1Q16878 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CDO1Q16878 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CDO1Q16878 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CDO1Q16878 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CDO1Q16878 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CDO1Q16878 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CDO1Q16878 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CDO1Q16878 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC0.29□□□□□ -2.36
CDO1Q16878 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.3 ms