Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SNRNP35Q16560 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SNRNP35Q16560 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SNRNP35Q16560 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SNRNP35Q16560 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SNRNP35Q16560 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SNRNP35Q16560 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SNRNP35Q16560 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SNRNP35Q16560 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SNRNP35Q16560 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SNRNP35Q16560 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SNRNP35Q16560 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SNRNP35Q16560 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SNRNP35Q16560 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SNRNP35Q16560 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SNRNP35Q16560 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SNRNP35Q16560 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.08□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.03□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
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