Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
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SSX1Q16384 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
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SSX1Q16384 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
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SSX1Q16384 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
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SSX1Q16384 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SSX1Q16384 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
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SSX1Q16384 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
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SSX1Q16384 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
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SSX1Q16384 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
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SSX1Q16384 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SSX1Q16384 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SSX1Q16384 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SSX1Q16384 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SSX1Q16384 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SSX1Q16384 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SSX1Q16384 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SSX1Q16384 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SSX1Q16384 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SSX1Q16384 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SSX1Q16384 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SSX1Q16384 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SSX1Q16384 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
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