Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC-1.34□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC-1.34□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC-1.36□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC-1.36□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC-1.37□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC-1.37□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
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NEDD8Q15843 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
NEDD8Q15843 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
NEDD8Q15843 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
NEDD8Q15843 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
NEDD8Q15843 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
NEDD8Q15843 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
NEDD8Q15843 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
NEDD8Q15843 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
NEDD8Q15843 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
NEDD8Q15843 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
NEDD8Q15843 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
NEDD8Q15843 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
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