Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
HMGN3Q15651 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
HMGN3Q15651 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
HMGN3Q15651 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
HMGN3Q15651 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC-2.61□□□□□ -2.83
HMGN3Q15651 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
HMGN3Q15651 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
HMGN3Q15651 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
HMGN3Q15651 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
HMGN3Q15651 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
HMGN3Q15651 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
HMGN3Q15651 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
HMGN3Q15651 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
HMGN3Q15651 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
HMGN3Q15651 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
HMGN3Q15651 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
HMGN3Q15651 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
HMGN3Q15651 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
HMGN3Q15651 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
HMGN3Q15651 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
HMGN3Q15651 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
HMGN3Q15651 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
HMGN3Q15651 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
HMGN3Q15651 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
HMGN3Q15651 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
HMGN3Q15651 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
HMGN3Q15651 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
HMGN3Q15651 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
HMGN3Q15651 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
HMGN3Q15651 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
HMGN3Q15651 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
HMGN3Q15651 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
HMGN3Q15651 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
HMGN3Q15651 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
HMGN3Q15651 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
HMGN3Q15651 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
HMGN3Q15651 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
HMGN3Q15651 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
HMGN3Q15651 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
HMGN3Q15651 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
HMGN3Q15651 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
HMGN3Q15651 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
HMGN3Q15651 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
HMGN3Q15651 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
HMGN3Q15651 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
HMGN3Q15651 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
HMGN3Q15651 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
HMGN3Q15651 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC-2.67□□□□□ -2.84
HMGN3Q15651 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
HMGN3Q15651 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
HMGN3Q15651 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
HMGN3Q15651 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
HMGN3Q15651 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
HMGN3Q15651 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC-2.68□□□□□ -2.84
HMGN3Q15651 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
HMGN3Q15651 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
HMGN3Q15651 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
HMGN3Q15651 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
HMGN3Q15651 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
HMGN3Q15651 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
HMGN3Q15651 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
HMGN3Q15651 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
HMGN3Q15651 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
HMGN3Q15651 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
HMGN3Q15651 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
HMGN3Q15651 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
HMGN3Q15651 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
HMGN3Q15651 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
HMGN3Q15651 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
HMGN3Q15651 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
HMGN3Q15651 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC-2.7□□□□□ -2.84
HMGN3Q15651 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC-2.7□□□□□ -2.84
HMGN3Q15651 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
HMGN3Q15651 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
HMGN3Q15651 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
HMGN3Q15651 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
HMGN3Q15651 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
HMGN3Q15651 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
HMGN3Q15651 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
HMGN3Q15651 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
HMGN3Q15651 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
HMGN3Q15651 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
HMGN3Q15651 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
HMGN3Q15651 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
HMGN3Q15651 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
HMGN3Q15651 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
HMGN3Q15651 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
HMGN3Q15651 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
HMGN3Q15651 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
HMGN3Q15651 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
HMGN3Q15651 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
HMGN3Q15651 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
HMGN3Q15651 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
HMGN3Q15651 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
HMGN3Q15651 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
HMGN3Q15651 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
HMGN3Q15651 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
HMGN3Q15651 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
HMGN3Q15651 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
HMGN3Q15651 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.3 ms