Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SEC23BQ15437 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SEC23BQ15437 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SEC23BQ15437 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SEC23BQ15437 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SEC23BQ15437 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SEC23BQ15437 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SEC23BQ15437 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SEC23BQ15437 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SEC23BQ15437 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SEC23BQ15437 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SEC23BQ15437 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SEC23BQ15437 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SEC23BQ15437 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SEC23BQ15437 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SEC23BQ15437 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SEC23BQ15437 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SEC23BQ15437 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SEC23BQ15437 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SEC23BQ15437 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SEC23BQ15437 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
SEC23BQ15437 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SEC23BQ15437 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SEC23BQ15437 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SEC23BQ15437 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SEC23BQ15437 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SEC23BQ15437 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SEC23BQ15437 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SEC23BQ15437 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SEC23BQ15437 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SEC23BQ15437 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SEC23BQ15437 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SEC23BQ15437 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SEC23BQ15437 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SEC23BQ15437 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SEC23BQ15437 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
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