Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SEC23AQ15436 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SEC23AQ15436 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
SEC23AQ15436 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SEC23AQ15436 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SEC23AQ15436 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SEC23AQ15436 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SEC23AQ15436 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SEC23AQ15436 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SEC23AQ15436 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
SEC23AQ15436 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SEC23AQ15436 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SEC23AQ15436 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SEC23AQ15436 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SEC23AQ15436 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SEC23AQ15436 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
SEC23AQ15436 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SEC23AQ15436 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SEC23AQ15436 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SEC23AQ15436 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SEC23AQ15436 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SEC23AQ15436 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SEC23AQ15436 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SEC23AQ15436 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
SEC23AQ15436 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SEC23AQ15436 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SEC23AQ15436 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SEC23AQ15436 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SEC23AQ15436 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SEC23AQ15436 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SEC23AQ15436 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SEC23AQ15436 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SEC23AQ15436 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SEC23AQ15436 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SEC23AQ15436 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SEC23AQ15436 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SEC23AQ15436 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SEC23AQ15436 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SEC23AQ15436 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SEC23AQ15436 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SEC23AQ15436 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SEC23AQ15436 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SEC23AQ15436 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SEC23AQ15436 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SEC23AQ15436 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
SEC23AQ15436 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SEC23AQ15436 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SEC23AQ15436 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SEC23AQ15436 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SEC23AQ15436 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SEC23AQ15436 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SEC23AQ15436 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SEC23AQ15436 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
SEC23AQ15436 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SEC23AQ15436 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SEC23AQ15436 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SEC23AQ15436 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SEC23AQ15436 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SEC23AQ15436 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SEC23AQ15436 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SEC23AQ15436 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SEC23AQ15436 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SEC23AQ15436 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SEC23AQ15436 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
SEC23AQ15436 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SEC23AQ15436 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SEC23AQ15436 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SEC23AQ15436 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SEC23AQ15436 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SEC23AQ15436 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SEC23AQ15436 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SEC23AQ15436 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SEC23AQ15436 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
SEC23AQ15436 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SEC23AQ15436 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SEC23AQ15436 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SEC23AQ15436 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SEC23AQ15436 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SEC23AQ15436 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SEC23AQ15436 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SEC23AQ15436 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SEC23AQ15436 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SEC23AQ15436 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SEC23AQ15436 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SEC23AQ15436 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SEC23AQ15436 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SEC23AQ15436 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SEC23AQ15436 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SEC23AQ15436 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SEC23AQ15436 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SEC23AQ15436 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SEC23AQ15436 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SEC23AQ15436 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SEC23AQ15436 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SEC23AQ15436 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SEC23AQ15436 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SEC23AQ15436 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SEC23AQ15436 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SEC23AQ15436 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SEC23AQ15436 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
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