Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PDCD1Q15116 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
PDCD1Q15116 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PDCD1Q15116 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PDCD1Q15116 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PDCD1Q15116 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PDCD1Q15116 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PDCD1Q15116 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PDCD1Q15116 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PDCD1Q15116 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PDCD1Q15116 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PDCD1Q15116 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PDCD1Q15116 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PDCD1Q15116 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PDCD1Q15116 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PDCD1Q15116 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PDCD1Q15116 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PDCD1Q15116 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PDCD1Q15116 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PDCD1Q15116 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PDCD1Q15116 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PDCD1Q15116 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PDCD1Q15116 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PDCD1Q15116 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PDCD1Q15116 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PDCD1Q15116 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PDCD1Q15116 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PDCD1Q15116 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PDCD1Q15116 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PDCD1Q15116 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PDCD1Q15116 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PDCD1Q15116 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PDCD1Q15116 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PDCD1Q15116 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PDCD1Q15116 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PDCD1Q15116 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PDCD1Q15116 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PDCD1Q15116 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PDCD1Q15116 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PDCD1Q15116 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
PDCD1Q15116 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
PDCD1Q15116 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PDCD1Q15116 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PDCD1Q15116 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PDCD1Q15116 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PDCD1Q15116 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PDCD1Q15116 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PDCD1Q15116 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PDCD1Q15116 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PDCD1Q15116 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PDCD1Q15116 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PDCD1Q15116 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PDCD1Q15116 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PDCD1Q15116 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
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