Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NCAPHQ15003 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NCAPHQ15003 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NCAPHQ15003 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NCAPHQ15003 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NCAPHQ15003 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NCAPHQ15003 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NCAPHQ15003 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NCAPHQ15003 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NCAPHQ15003 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
NCAPHQ15003 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NCAPHQ15003 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
NCAPHQ15003 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NCAPHQ15003 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NCAPHQ15003 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
NCAPHQ15003 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
NCAPHQ15003 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
NCAPHQ15003 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
NCAPHQ15003 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NCAPHQ15003 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NCAPHQ15003 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NCAPHQ15003 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NCAPHQ15003 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NCAPHQ15003 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NCAPHQ15003 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NCAPHQ15003 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NCAPHQ15003 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NCAPHQ15003 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NCAPHQ15003 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NCAPHQ15003 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NCAPHQ15003 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NCAPHQ15003 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NCAPHQ15003 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NCAPHQ15003 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NCAPHQ15003 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NCAPHQ15003 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NCAPHQ15003 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NCAPHQ15003 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NCAPHQ15003 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NCAPHQ15003 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NCAPHQ15003 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NCAPHQ15003 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NCAPHQ15003 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NCAPHQ15003 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NCAPHQ15003 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NCAPHQ15003 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NCAPHQ15003 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NCAPHQ15003 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NCAPHQ15003 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NCAPHQ15003 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
NCAPHQ15003 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NCAPHQ15003 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NCAPHQ15003 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NCAPHQ15003 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NCAPHQ15003 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
NCAPHQ15003 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NCAPHQ15003 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NCAPHQ15003 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NCAPHQ15003 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NCAPHQ15003 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
NCAPHQ15003 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NCAPHQ15003 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NCAPHQ15003 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NCAPHQ15003 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NCAPHQ15003 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NCAPHQ15003 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NCAPHQ15003 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NCAPHQ15003 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NCAPHQ15003 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NCAPHQ15003 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
NCAPHQ15003 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NCAPHQ15003 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NCAPHQ15003 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NCAPHQ15003 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NCAPHQ15003 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NCAPHQ15003 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NCAPHQ15003 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
NCAPHQ15003 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NCAPHQ15003 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
NCAPHQ15003 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NCAPHQ15003 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NCAPHQ15003 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NCAPHQ15003 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
NCAPHQ15003 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
NCAPHQ15003 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
NCAPHQ15003 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NCAPHQ15003 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NCAPHQ15003 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NCAPHQ15003 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NCAPHQ15003 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NCAPHQ15003 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NCAPHQ15003 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
NCAPHQ15003 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NCAPHQ15003 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NCAPHQ15003 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NCAPHQ15003 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NCAPHQ15003 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NCAPHQ15003 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NCAPHQ15003 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
NCAPHQ15003 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
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