Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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