| RUNX2 | Q13950 | RNY1P6-201 | ENST00000384193 | 109 nt | BASIC | 1.02 | □□□□□ -2.25 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR563-201 | ENST00000385080 | 79 nt | BASIC | 1.02 | □□□□□ -2.25 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.584-201 | ENST00000391090 | 114 nt | BASIC | 1.02 | □□□□□ -2.25 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD111-201 | ENST00000408139 | 94 nt | BASIC | 1.02 | □□□□□ -2.25 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1258P-201 | ENST00000516911 | 111 nt | BASIC | 1.02 | □□□□□ -2.25 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-255P-201 | ENST00000516957 | 105 nt | BASIC | 1.02 | □□□□□ -2.25 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC010177.1-201 | ENST00000547819 | 366 nt | TSL 3 BASIC | 1.02 | □□□□□ -2.25 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC079466.2-201 | ENST00000585394 | 185 nt | TSL 5 BASIC | 1.02 | □□□□□ -2.25 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-369P-201 | ENST00000362515 | 102 nt | BASIC | 1.01 | □□□□□ -2.25 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR1285-1-201 | ENST00000408593 | 84 nt | BASIC | 1.01 | □□□□□ -2.25 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP261-201 | ENST00000410536 | 106 nt | BASIC | 1.01 | □□□□□ -2.25 | | |
| RUNX2 | Q13950 | POLR2J4-204 | ENST00000418424 | 324 nt | BASIC | 1.01 | □□□□□ -2.25 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC073127.1-201 | ENST00000447336 | 333 nt | TSL 3 BASIC | 1.01 | □□□□□ -2.25 | | |
| RUNX2 | Q13950 | snoU13.2-201 | ENST00000459201 | 104 nt | BASIC | 1.01 | □□□□□ -2.25 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD114-21-201 | ENST00000606412 | 72 nt | BASIC | 1.01 | □□□□□ -2.25 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MGAT4C-209 | ENST00000611864 | 25116 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 1 | □□□□□ -2.25 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA22.1-201 | ENST00000362701 | 134 nt | BASIC | 1 | □□□□□ -2.25 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.120-201 | ENST00000363304 | 110 nt | BASIC | 1 | □□□□□ -2.25 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD114-22-201 | ENST00000365423 | 72 nt | BASIC | 1 | □□□□□ -2.25 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-460P-201 | ENST00000391158 | 108 nt | BASIC | 1 | □□□□□ -2.25 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU7-62P-201 | ENST00000458856 | 62 nt | BASIC | 1 | □□□□□ -2.25 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC087343.1-201 | ENST00000477341 | 475 nt | BASIC | 1 | □□□□□ -2.25 | | |
| RUNX2 | Q13950 | UBL5P1-201 | ENST00000507979 | 193 nt | BASIC | 1 | □□□□□ -2.25 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR4661-201 | ENST00000582720 | 75 nt | BASIC | 1 | □□□□□ -2.25 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZNF518A-210 | ENST00000624776 | 7994 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1 | □□□□□ -2.25 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.215-201 | ENST00000364204 | 112 nt | BASIC | 0.99 | □□□□□ -2.25 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-309P-201 | ENST00000364573 | 106 nt | BASIC | 0.99 | □□□□□ -2.25 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.400-201 | ENST00000383963 | 111 nt | BASIC | 0.99 | □□□□□ -2.25 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-209P-201 | ENST00000384118 | 107 nt | BASIC | 0.99 | □□□□□ -2.25 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR588-201 | ENST00000384900 | 83 nt | BASIC | 0.99 | □□□□□ -2.25 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR569-201 | ENST00000385228 | 96 nt | BASIC | 0.99 | □□□□□ -2.25 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP144-201 | ENST00000410846 | 116 nt | BASIC | 0.99 | □□□□□ -2.25 | | |
| RUNX2 | Q13950 | FABP5P4-201 | ENST00000437203 | 171 nt | BASIC | 0.99 | □□□□□ -2.25 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU7-200P-201 | ENST00000516105 | 62 nt | BASIC | 0.99 | □□□□□ -2.25 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.757-201 | ENST00000578934 | 114 nt | BASIC | 0.99 | □□□□□ -2.25 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL603914.1-201 | ENST00000401964 | 204 nt | BASIC | 0.98 | □□□□□ -2.25 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPS29P28-201 | ENST00000446439 | 141 nt | BASIC | 0.98 | □□□□□ -2.25 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA25.12-201 | ENST00000516202 | 82 nt | BASIC | 0.98 | □□□□□ -2.25 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR548X2-201 | ENST00000579776 | 100 nt | BASIC | 0.98 | □□□□□ -2.25 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR3152-201 | ENST00000579801 | 74 nt | BASIC | 0.98 | □□□□□ -2.25 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC108866.1-201 | ENST00000503073 | 2339 nt | TSL 5 BASIC | 0.97 | □□□□□ -2.25 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.506-201 | ENST00000384494 | 102 nt | BASIC | 0.97 | □□□□□ -2.25 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA20-201 | ENST00000384662 | 132 nt | BASIC | 0.97 | □□□□□ -2.25 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR489-201 | ENST00000384923 | 84 nt | BASIC | 0.97 | □□□□□ -2.25 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR942-201 | ENST00000401111 | 86 nt | BASIC | 0.97 | □□□□□ -2.25 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD83.1-201 | ENST00000411362 | 77 nt | BASIC | 0.97 | □□□□□ -2.25 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTATP6P21-201 | ENST00000440681 | 189 nt | BASIC | 0.97 | □□□□□ -2.25 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-240P-201 | ENST00000516098 | 97 nt | BASIC | 0.97 | □□□□□ -2.25 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.690-201 | ENST00000516603 | 95 nt | BASIC | 0.97 | □□□□□ -2.25 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC011603.4-201 | ENST00000611325 | 277 nt | BASIC | 0.97 | □□□□□ -2.25 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SENP7-207 | ENST00000394095 | 4945 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 0.96 | □□□□□ -2.26 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC010332.2-201 | ENST00000613083 | 1904 nt | BASIC | 0.96 | □□□□□ -2.26 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR30D-201 | ENST00000362283 | 70 nt | BASIC | 0.96 | □□□□□ -2.26 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.171-201 | ENST00000363760 | 102 nt | BASIC | 0.96 | □□□□□ -2.26 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1335P-201 | ENST00000365426 | 107 nt | BASIC | 0.96 | □□□□□ -2.26 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.354-201 | ENST00000365448 | 111 nt | BASIC | 0.96 | □□□□□ -2.26 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA22-201 | ENST00000383907 | 134 nt | BASIC | 0.96 | □□□□□ -2.26 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA22C-201 | ENST00000384614 | 134 nt | BASIC | 0.96 | □□□□□ -2.26 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR1827-201 | ENST00000408549 | 66 nt | BASIC | 0.96 | □□□□□ -2.26 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1165P-201 | ENST00000410119 | 107 nt | BASIC | 0.96 | □□□□□ -2.26 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC015818.7-201 | ENST00000428754 | 109 nt | BASIC | 0.96 | □□□□□ -2.26 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC087499.7-201 | ENST00000441958 | 109 nt | BASIC | 0.96 | □□□□□ -2.26 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP255-201 | ENST00000516370 | 107 nt | BASIC | 0.96 | □□□□□ -2.26 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC032019.2-201 | ENST00000584916 | 403 nt | TSL 5 BASIC | 0.96 | □□□□□ -2.26 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HOTAIRM1_4.1-201 | ENST00000617934 | 102 nt | BASIC | 0.96 | □□□□□ -2.26 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU4-38P-201 | ENST00000364472 | 129 nt | BASIC | 0.95 | □□□□□ -2.26 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-915P-201 | ENST00000364943 | 103 nt | BASIC | 0.95 | □□□□□ -2.26 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU1-36P-201 | ENST00000365130 | 165 nt | BASIC | 0.95 | □□□□□ -2.26 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-690P-201 | ENST00000365242 | 106 nt | BASIC | 0.95 | □□□□□ -2.26 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR513C-201 | ENST00000401352 | 84 nt | BASIC | 0.95 | □□□□□ -2.26 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-994P-201 | ENST00000410507 | 111 nt | BASIC | 0.95 | □□□□□ -2.26 | | |
| RUNX2 | Q13950 | U7.7-201 | ENST00000459276 | 60 nt | BASIC | 0.95 | □□□□□ -2.26 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU2-35P-201 | ENST00000516446 | 142 nt | BASIC | 0.95 | □□□□□ -2.26 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC108081.1-201 | ENST00000604358 | 221 nt | BASIC | 0.95 | □□□□□ -2.26 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD114-27-201 | ENST00000363766 | 70 nt | BASIC | 0.94 | □□□□□ -2.26 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.420-201 | ENST00000384043 | 110 nt | BASIC | 0.94 | □□□□□ -2.26 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6ATAC6P-201 | ENST00000408132 | 126 nt | BASIC | 0.94 | □□□□□ -2.26 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PDCD5P2-201 | ENST00000507570 | 312 nt | BASIC | 0.94 | □□□□□ -2.26 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP272-201 | ENST00000516095 | 111 nt | BASIC | 0.94 | □□□□□ -2.26 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-113P-201 | ENST00000516653 | 101 nt | BASIC | 0.94 | □□□□□ -2.26 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL662814.1-201 | ENST00000617364 | 121 nt | BASIC | 0.94 | □□□□□ -2.26 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP001340.1-201 | ENST00000624405 | 217 nt | BASIC | 0.94 | □□□□□ -2.26 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-934P-201 | ENST00000365154 | 107 nt | BASIC | 0.93 | □□□□□ -2.26 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.366-201 | ENST00000365540 | 102 nt | BASIC | 0.93 | □□□□□ -2.26 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD18B-201 | ENST00000365659 | 72 nt | BASIC | 0.93 | □□□□□ -2.26 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNY1P5-201 | ENST00000383890 | 115 nt | BASIC | 0.93 | □□□□□ -2.26 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.470-201 | ENST00000384307 | 117 nt | BASIC | 0.93 | □□□□□ -2.26 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-342P-201 | ENST00000384521 | 104 nt | BASIC | 0.93 | □□□□□ -2.26 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPS26P5-201 | ENST00000418544 | 335 nt | BASIC | 0.93 | □□□□□ -2.26 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-346P-201 | ENST00000516288 | 111 nt | BASIC | 0.93 | □□□□□ -2.26 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-426P-201 | ENST00000516464 | 97 nt | BASIC | 0.93 | □□□□□ -2.26 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR3121-201 | ENST00000579680 | 77 nt | BASIC | 0.93 | □□□□□ -2.26 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR4305-201 | ENST00000583252 | 102 nt | BASIC | 0.93 | □□□□□ -2.26 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC020891.4-201 | ENST00000605745 | 93 nt | BASIC | 0.93 | □□□□□ -2.26 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR96-201 | ENST00000362288 | 78 nt | BASIC | 0.92 | □□□□□ -2.26 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.280-201 | ENST00000364765 | 112 nt | BASIC | 0.92 | □□□□□ -2.26 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD89-201 | ENST00000390981 | 114 nt | BASIC | 0.92 | □□□□□ -2.26 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL512326.2-201 | ENST00000426359 | 151 nt | BASIC | 0.92 | □□□□□ -2.26 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR18B-201 | ENST00000454574 | 71 nt | BASIC | 0.92 | □□□□□ -2.26 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC092892.1-201 | ENST00000496067 | 327 nt | TSL 5 BASIC | 0.92 | □□□□□ -2.26 | | |