Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GTF2H2Q13888 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GTF2H2Q13888 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GTF2H2Q13888 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
GTF2H2Q13888 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GTF2H2Q13888 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GTF2H2Q13888 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GTF2H2Q13888 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GTF2H2Q13888 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GTF2H2Q13888 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GTF2H2Q13888 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GTF2H2Q13888 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GTF2H2Q13888 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
GTF2H2Q13888 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
GTF2H2Q13888 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GTF2H2Q13888 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GTF2H2Q13888 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GTF2H2Q13888 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GTF2H2Q13888 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GTF2H2Q13888 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GTF2H2Q13888 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GTF2H2Q13888 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GTF2H2Q13888 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GTF2H2Q13888 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GTF2H2Q13888 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GTF2H2Q13888 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GTF2H2Q13888 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GTF2H2Q13888 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GTF2H2Q13888 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GTF2H2Q13888 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
GTF2H2Q13888 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GTF2H2Q13888 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GTF2H2Q13888 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GTF2H2Q13888 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GTF2H2Q13888 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GTF2H2Q13888 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GTF2H2Q13888 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GTF2H2Q13888 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
GTF2H2Q13888 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GTF2H2Q13888 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GTF2H2Q13888 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GTF2H2Q13888 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GTF2H2Q13888 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GTF2H2Q13888 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GTF2H2Q13888 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
GTF2H2Q13888 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
GTF2H2Q13888 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GTF2H2Q13888 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GTF2H2Q13888 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GTF2H2Q13888 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GTF2H2Q13888 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GTF2H2Q13888 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GTF2H2Q13888 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GTF2H2Q13888 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
GTF2H2Q13888 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
GTF2H2Q13888 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
GTF2H2Q13888 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GTF2H2Q13888 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GTF2H2Q13888 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GTF2H2Q13888 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GTF2H2Q13888 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GTF2H2Q13888 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GTF2H2Q13888 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GTF2H2Q13888 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GTF2H2Q13888 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GTF2H2Q13888 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GTF2H2Q13888 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
GTF2H2Q13888 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GTF2H2Q13888 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GTF2H2Q13888 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GTF2H2Q13888 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GTF2H2Q13888 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GTF2H2Q13888 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GTF2H2Q13888 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GTF2H2Q13888 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GTF2H2Q13888 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GTF2H2Q13888 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GTF2H2Q13888 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GTF2H2Q13888 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GTF2H2Q13888 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
GTF2H2Q13888 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
GTF2H2Q13888 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GTF2H2Q13888 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GTF2H2Q13888 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GTF2H2Q13888 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GTF2H2Q13888 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GTF2H2Q13888 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GTF2H2Q13888 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GTF2H2Q13888 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GTF2H2Q13888 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
GTF2H2Q13888 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GTF2H2Q13888 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GTF2H2Q13888 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GTF2H2Q13888 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GTF2H2Q13888 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GTF2H2Q13888 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GTF2H2Q13888 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
GTF2H2Q13888 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
GTF2H2Q13888 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
GTF2H2Q13888 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
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