Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RUNX3Q13761 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RUNX3Q13761 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RUNX3Q13761 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RUNX3Q13761 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RUNX3Q13761 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RUNX3Q13761 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RUNX3Q13761 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RUNX3Q13761 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RUNX3Q13761 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RUNX3Q13761 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RUNX3Q13761 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RUNX3Q13761 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RUNX3Q13761 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RUNX3Q13761 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RUNX3Q13761 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RUNX3Q13761 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RUNX3Q13761 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RUNX3Q13761 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
RUNX3Q13761 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
RUNX3Q13761 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
RUNX3Q13761 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
RUNX3Q13761 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
RUNX3Q13761 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
RUNX3Q13761 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
RUNX3Q13761 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
RUNX3Q13761 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
RUNX3Q13761 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
RUNX3Q13761 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
RUNX3Q13761 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
RUNX3Q13761 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
RUNX3Q13761 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
RUNX3Q13761 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
RUNX3Q13761 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
RUNX3Q13761 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
RUNX3Q13761 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC0.78□□□□□ -2.28
RUNX3Q13761 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
RUNX3Q13761 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
RUNX3Q13761 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
RUNX3Q13761 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
RUNX3Q13761 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
RUNX3Q13761 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
RUNX3Q13761 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
RUNX3Q13761 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RUNX3Q13761 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
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