Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.77□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CDH18Q13634 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CDH18Q13634 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CDH18Q13634 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CDH18Q13634 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CDH18Q13634 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CDH18Q13634 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CDH18Q13634 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CDH18Q13634 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CDH18Q13634 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CDH18Q13634 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CDH18Q13634 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CDH18Q13634 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CDH18Q13634 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CDH18Q13634 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CDH18Q13634 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CDH18Q13634 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CDH18Q13634 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CDH18Q13634 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CDH18Q13634 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CDH18Q13634 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CDH18Q13634 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CDH18Q13634 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CDH18Q13634 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CDH18Q13634 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CDH18Q13634 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CDH18Q13634 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
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