Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NEUROD1Q13562 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NEUROD1Q13562 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NEUROD1Q13562 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NEUROD1Q13562 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NEUROD1Q13562 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NEUROD1Q13562 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NEUROD1Q13562 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NEUROD1Q13562 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NEUROD1Q13562 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NEUROD1Q13562 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NEUROD1Q13562 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NEUROD1Q13562 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NEUROD1Q13562 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NEUROD1Q13562 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NEUROD1Q13562 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
NEUROD1Q13562 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NEUROD1Q13562 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NEUROD1Q13562 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NEUROD1Q13562 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NEUROD1Q13562 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NEUROD1Q13562 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NEUROD1Q13562 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NEUROD1Q13562 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NEUROD1Q13562 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
NEUROD1Q13562 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NEUROD1Q13562 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NEUROD1Q13562 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NEUROD1Q13562 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NEUROD1Q13562 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
NEUROD1Q13562 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NEUROD1Q13562 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NEUROD1Q13562 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NEUROD1Q13562 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NEUROD1Q13562 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NEUROD1Q13562 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NEUROD1Q13562 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NEUROD1Q13562 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NEUROD1Q13562 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NEUROD1Q13562 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NEUROD1Q13562 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NEUROD1Q13562 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NEUROD1Q13562 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NEUROD1Q13562 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NEUROD1Q13562 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NEUROD1Q13562 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NEUROD1Q13562 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NEUROD1Q13562 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NEUROD1Q13562 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NEUROD1Q13562 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NEUROD1Q13562 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NEUROD1Q13562 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NEUROD1Q13562 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NEUROD1Q13562 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NEUROD1Q13562 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NEUROD1Q13562 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NEUROD1Q13562 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NEUROD1Q13562 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NEUROD1Q13562 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NEUROD1Q13562 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NEUROD1Q13562 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NEUROD1Q13562 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NEUROD1Q13562 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
NEUROD1Q13562 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
NEUROD1Q13562 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NEUROD1Q13562 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NEUROD1Q13562 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NEUROD1Q13562 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NEUROD1Q13562 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NEUROD1Q13562 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NEUROD1Q13562 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NEUROD1Q13562 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NEUROD1Q13562 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NEUROD1Q13562 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NEUROD1Q13562 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NEUROD1Q13562 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NEUROD1Q13562 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
NEUROD1Q13562 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
NEUROD1Q13562 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NEUROD1Q13562 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NEUROD1Q13562 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NEUROD1Q13562 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NEUROD1Q13562 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NEUROD1Q13562 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NEUROD1Q13562 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
NEUROD1Q13562 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
NEUROD1Q13562 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NEUROD1Q13562 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NEUROD1Q13562 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NEUROD1Q13562 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NEUROD1Q13562 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NEUROD1Q13562 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NEUROD1Q13562 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NEUROD1Q13562 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NEUROD1Q13562 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NEUROD1Q13562 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
NEUROD1Q13562 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NEUROD1Q13562 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NEUROD1Q13562 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NEUROD1Q13562 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
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