Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ATRQ13535 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ATRQ13535 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC-1.15□□□□□ -2.59
ATRQ13535 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ATRQ13535 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ATRQ13535 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ATRQ13535 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ATRQ13535 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
ATRQ13535 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC-1.16□□□□□ -2.59
ATRQ13535 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
ATRQ13535 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
ATRQ13535 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ATRQ13535 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ATRQ13535 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC-1.16□□□□□ -2.6
ATRQ13535 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ATRQ13535 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ATRQ13535 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ATRQ13535 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ATRQ13535 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ATRQ13535 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ATRQ13535 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ATRQ13535 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ATRQ13535 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ATRQ13535 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ATRQ13535 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ATRQ13535 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ATRQ13535 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ATRQ13535 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ATRQ13535 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ATRQ13535 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ATRQ13535 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ATRQ13535 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-1.17□□□□□ -2.6
ATRQ13535 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ATRQ13535 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ATRQ13535 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ATRQ13535 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ATRQ13535 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ATRQ13535 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ATRQ13535 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ATRQ13535 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ATRQ13535 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ATRQ13535 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ATRQ13535 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ATRQ13535 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ATRQ13535 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ATRQ13535 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ATRQ13535 Y_RNA.520-201ENST00000384556 102 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ATRQ13535 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ATRQ13535 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ATRQ13535 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ATRQ13535 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ATRQ13535 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ATRQ13535 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC-1.18□□□□□ -2.6
ATRQ13535 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ATRQ13535 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ATRQ13535 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ATRQ13535 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ATRQ13535 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ATRQ13535 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ATRQ13535 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ATRQ13535 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ATRQ13535 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC-1.19□□□□□ -2.6
ATRQ13535 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ATRQ13535 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ATRQ13535 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ATRQ13535 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ATRQ13535 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ATRQ13535 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ATRQ13535 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ATRQ13535 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ATRQ13535 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ATRQ13535 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ATRQ13535 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC-1.19□□□□□ -2.6
ATRQ13535 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ATRQ13535 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ATRQ13535 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ATRQ13535 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ATRQ13535 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ATRQ13535 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC-1.2□□□□□ -2.6
ATRQ13535 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ATRQ13535 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ATRQ13535 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ATRQ13535 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ATRQ13535 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC-1.2□□□□□ -2.6
ATRQ13535 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ATRQ13535 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ATRQ13535 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ATRQ13535 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ATRQ13535 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ATRQ13535 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ATRQ13535 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ATRQ13535 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ATRQ13535 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ATRQ13535 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC-1.21□□□□□ -2.6
ATRQ13535 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC-1.21□□□□□ -2.6
ATRQ13535 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC-1.21□□□□□ -2.6
ATRQ13535 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ATRQ13535 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ATRQ13535 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ATRQ13535 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
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