Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SMAD4Q13485 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMAD4Q13485 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMAD4Q13485 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SMAD4Q13485 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMAD4Q13485 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMAD4Q13485 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMAD4Q13485 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMAD4Q13485 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMAD4Q13485 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMAD4Q13485 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMAD4Q13485 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMAD4Q13485 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMAD4Q13485 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SMAD4Q13485 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
SMAD4Q13485 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SMAD4Q13485 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMAD4Q13485 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMAD4Q13485 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMAD4Q13485 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SMAD4Q13485 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMAD4Q13485 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMAD4Q13485 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMAD4Q13485 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMAD4Q13485 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMAD4Q13485 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMAD4Q13485 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SMAD4Q13485 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMAD4Q13485 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMAD4Q13485 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMAD4Q13485 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SMAD4Q13485 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SMAD4Q13485 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SMAD4Q13485 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SMAD4Q13485 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SMAD4Q13485 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SMAD4Q13485 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SMAD4Q13485 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SMAD4Q13485 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMAD4Q13485 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMAD4Q13485 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMAD4Q13485 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMAD4Q13485 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMAD4Q13485 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMAD4Q13485 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SMAD4Q13485 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMAD4Q13485 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMAD4Q13485 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMAD4Q13485 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMAD4Q13485 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMAD4Q13485 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMAD4Q13485 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMAD4Q13485 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMAD4Q13485 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMAD4Q13485 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMAD4Q13485 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMAD4Q13485 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMAD4Q13485 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMAD4Q13485 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMAD4Q13485 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMAD4Q13485 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMAD4Q13485 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMAD4Q13485 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMAD4Q13485 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMAD4Q13485 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMAD4Q13485 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMAD4Q13485 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SMAD4Q13485 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SMAD4Q13485 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMAD4Q13485 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMAD4Q13485 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMAD4Q13485 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMAD4Q13485 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMAD4Q13485 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMAD4Q13485 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMAD4Q13485 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMAD4Q13485 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMAD4Q13485 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMAD4Q13485 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMAD4Q13485 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMAD4Q13485 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMAD4Q13485 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMAD4Q13485 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SMAD4Q13485 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMAD4Q13485 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SMAD4Q13485 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
SMAD4Q13485 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMAD4Q13485 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMAD4Q13485 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMAD4Q13485 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMAD4Q13485 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMAD4Q13485 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMAD4Q13485 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMAD4Q13485 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMAD4Q13485 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMAD4Q13485 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
SMAD4Q13485 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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