Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
TCOF1Q13428 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
TCOF1Q13428 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
TCOF1Q13428 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
TCOF1Q13428 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
TCOF1Q13428 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
TCOF1Q13428 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
TCOF1Q13428 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TCOF1Q13428 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TCOF1Q13428 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TCOF1Q13428 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TCOF1Q13428 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TCOF1Q13428 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TCOF1Q13428 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TCOF1Q13428 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TCOF1Q13428 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TCOF1Q13428 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TCOF1Q13428 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TCOF1Q13428 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TCOF1Q13428 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TCOF1Q13428 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TCOF1Q13428 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
TCOF1Q13428 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
TCOF1Q13428 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
TCOF1Q13428 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
TCOF1Q13428 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
TCOF1Q13428 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
TCOF1Q13428 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
TCOF1Q13428 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
TCOF1Q13428 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
TCOF1Q13428 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
TCOF1Q13428 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
TCOF1Q13428 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
TCOF1Q13428 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
TCOF1Q13428 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
TCOF1Q13428 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
TCOF1Q13428 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-1.55□□□□□ -2.66
TCOF1Q13428 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
TCOF1Q13428 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
TCOF1Q13428 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
TCOF1Q13428 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC-1.55□□□□□ -2.66
TCOF1Q13428 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TCOF1Q13428 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TCOF1Q13428 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TCOF1Q13428 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TCOF1Q13428 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TCOF1Q13428 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TCOF1Q13428 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TCOF1Q13428 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TCOF1Q13428 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TCOF1Q13428 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TCOF1Q13428 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TCOF1Q13428 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TCOF1Q13428 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TCOF1Q13428 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TCOF1Q13428 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TCOF1Q13428 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TCOF1Q13428 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TCOF1Q13428 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TCOF1Q13428 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TCOF1Q13428 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TCOF1Q13428 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
TCOF1Q13428 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
TCOF1Q13428 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
TCOF1Q13428 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
TCOF1Q13428 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC-1.57□□□□□ -2.66
TCOF1Q13428 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
TCOF1Q13428 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
TCOF1Q13428 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
TCOF1Q13428 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
TCOF1Q13428 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
TCOF1Q13428 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
TCOF1Q13428 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
TCOF1Q13428 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
TCOF1Q13428 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
TCOF1Q13428 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
TCOF1Q13428 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
TCOF1Q13428 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
TCOF1Q13428 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
TCOF1Q13428 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
TCOF1Q13428 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
TCOF1Q13428 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
TCOF1Q13428 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
TCOF1Q13428 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
TCOF1Q13428 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
TCOF1Q13428 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
TCOF1Q13428 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
TCOF1Q13428 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
TCOF1Q13428 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
TCOF1Q13428 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
TCOF1Q13428 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
TCOF1Q13428 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
TCOF1Q13428 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
TCOF1Q13428 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
TCOF1Q13428 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
TCOF1Q13428 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
TCOF1Q13428 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
TCOF1Q13428 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
TCOF1Q13428 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
TCOF1Q13428 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
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