Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
AP3B2Q13367 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
AP3B2Q13367 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
AP3B2Q13367 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
AP3B2Q13367 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.05
AP3B2Q13367 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
AP3B2Q13367 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
AP3B2Q13367 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
AP3B2Q13367 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
AP3B2Q13367 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
AP3B2Q13367 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
AP3B2Q13367 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
AP3B2Q13367 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
AP3B2Q13367 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
AP3B2Q13367 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
AP3B2Q13367 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
AP3B2Q13367 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
AP3B2Q13367 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
AP3B2Q13367 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
AP3B2Q13367 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
AP3B2Q13367 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
AP3B2Q13367 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
AP3B2Q13367 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
AP3B2Q13367 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
AP3B2Q13367 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
AP3B2Q13367 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
AP3B2Q13367 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
AP3B2Q13367 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
AP3B2Q13367 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
AP3B2Q13367 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
AP3B2Q13367 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
AP3B2Q13367 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
AP3B2Q13367 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
AP3B2Q13367 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
AP3B2Q13367 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
AP3B2Q13367 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
AP3B2Q13367 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
AP3B2Q13367 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
AP3B2Q13367 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
AP3B2Q13367 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
AP3B2Q13367 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
AP3B2Q13367 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
AP3B2Q13367 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
AP3B2Q13367 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
AP3B2Q13367 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
AP3B2Q13367 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
AP3B2Q13367 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
AP3B2Q13367 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
AP3B2Q13367 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
AP3B2Q13367 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
AP3B2Q13367 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
AP3B2Q13367 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
AP3B2Q13367 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
AP3B2Q13367 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
AP3B2Q13367 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
AP3B2Q13367 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
AP3B2Q13367 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
AP3B2Q13367 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
AP3B2Q13367 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
AP3B2Q13367 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
AP3B2Q13367 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
AP3B2Q13367 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
AP3B2Q13367 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
AP3B2Q13367 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
AP3B2Q13367 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
AP3B2Q13367 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
AP3B2Q13367 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
AP3B2Q13367 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
AP3B2Q13367 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
AP3B2Q13367 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
AP3B2Q13367 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
AP3B2Q13367 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
AP3B2Q13367 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
AP3B2Q13367 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
AP3B2Q13367 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
AP3B2Q13367 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
AP3B2Q13367 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
AP3B2Q13367 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
AP3B2Q13367 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
AP3B2Q13367 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
AP3B2Q13367 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
AP3B2Q13367 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
AP3B2Q13367 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
AP3B2Q13367 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
AP3B2Q13367 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
AP3B2Q13367 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
AP3B2Q13367 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
AP3B2Q13367 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
AP3B2Q13367 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
AP3B2Q13367 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
AP3B2Q13367 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
AP3B2Q13367 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
AP3B2Q13367 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
AP3B2Q13367 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
AP3B2Q13367 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
AP3B2Q13367 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
AP3B2Q13367 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
AP3B2Q13367 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
AP3B2Q13367 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
AP3B2Q13367 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
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