Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SP140Q13342 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SP140Q13342 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SP140Q13342 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SP140Q13342 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SP140Q13342 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SP140Q13342 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SP140Q13342 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SP140Q13342 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SP140Q13342 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SP140Q13342 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SP140Q13342 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SP140Q13342 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SP140Q13342 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SP140Q13342 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SP140Q13342 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SP140Q13342 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SP140Q13342 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SP140Q13342 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
SP140Q13342 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.17
SP140Q13342 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SP140Q13342 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SP140Q13342 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SP140Q13342 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SP140Q13342 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SP140Q13342 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SP140Q13342 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SP140Q13342 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SP140Q13342 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SP140Q13342 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SP140Q13342 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SP140Q13342 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SP140Q13342 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SP140Q13342 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SP140Q13342 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SP140Q13342 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SP140Q13342 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SP140Q13342 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SP140Q13342 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
SP140Q13342 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SP140Q13342 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SP140Q13342 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SP140Q13342 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SP140Q13342 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SP140Q13342 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SP140Q13342 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SP140Q13342 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SP140Q13342 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SP140Q13342 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SP140Q13342 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SP140Q13342 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
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SP140Q13342 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SP140Q13342 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SP140Q13342 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SP140Q13342 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SP140Q13342 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SP140Q13342 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SP140Q13342 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SP140Q13342 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SP140Q13342 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SP140Q13342 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SP140Q13342 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SP140Q13342 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SP140Q13342 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SP140Q13342 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SP140Q13342 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SP140Q13342 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SP140Q13342 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SP140Q13342 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SP140Q13342 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SP140Q13342 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SP140Q13342 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SP140Q13342 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SP140Q13342 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
SP140Q13342 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SP140Q13342 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SP140Q13342 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SP140Q13342 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SP140Q13342 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SP140Q13342 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SP140Q13342 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SP140Q13342 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SP140Q13342 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SP140Q13342 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SP140Q13342 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SP140Q13342 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SP140Q13342 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SP140Q13342 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SP140Q13342 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SP140Q13342 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SP140Q13342 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SP140Q13342 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SP140Q13342 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SP140Q13342 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SP140Q13342 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SP140Q13342 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SP140Q13342 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SP140Q13342 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SP140Q13342 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
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