Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
ATMQ13315 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
ATMQ13315 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
ATMQ13315 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
ATMQ13315 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
ATMQ13315 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
ATMQ13315 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
ATMQ13315 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
ATMQ13315 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
ATMQ13315 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
ATMQ13315 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
ATMQ13315 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC-2.22□□□□□ -2.76
ATMQ13315 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
ATMQ13315 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
ATMQ13315 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
ATMQ13315 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
ATMQ13315 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
ATMQ13315 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
ATMQ13315 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
ATMQ13315 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
ATMQ13315 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
ATMQ13315 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
ATMQ13315 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
ATMQ13315 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
ATMQ13315 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
ATMQ13315 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
ATMQ13315 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
ATMQ13315 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
ATMQ13315 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
ATMQ13315 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
ATMQ13315 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
ATMQ13315 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
ATMQ13315 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
ATMQ13315 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-2.24□□□□□ -2.77
ATMQ13315 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
ATMQ13315 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC-2.25□□□□□ -2.77
ATMQ13315 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
ATMQ13315 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC-2.25□□□□□ -2.77
ATMQ13315 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-2.25□□□□□ -2.77
ATMQ13315 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
ATMQ13315 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
ATMQ13315 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
ATMQ13315 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
ATMQ13315 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
ATMQ13315 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
ATMQ13315 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
ATMQ13315 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
ATMQ13315 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
ATMQ13315 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
ATMQ13315 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
ATMQ13315 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
ATMQ13315 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
ATMQ13315 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
ATMQ13315 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
ATMQ13315 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
ATMQ13315 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
ATMQ13315 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
ATMQ13315 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
ATMQ13315 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
ATMQ13315 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
ATMQ13315 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
ATMQ13315 RNU6-167P-201ENST00000384292 106 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
ATMQ13315 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
ATMQ13315 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
ATMQ13315 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
ATMQ13315 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
ATMQ13315 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
ATMQ13315 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
ATMQ13315 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
ATMQ13315 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
ATMQ13315 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
ATMQ13315 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.78
ATMQ13315 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.78
ATMQ13315 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.78
ATMQ13315 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.78
ATMQ13315 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.78
ATMQ13315 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
ATMQ13315 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
ATMQ13315 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
ATMQ13315 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
ATMQ13315 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
ATMQ13315 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
ATMQ13315 MIR363-201ENST00000384840 75 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
ATMQ13315 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
ATMQ13315 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
ATMQ13315 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
ATMQ13315 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
ATMQ13315 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
ATMQ13315 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
ATMQ13315 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC-2.29□□□□□ -2.78
ATMQ13315 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
ATMQ13315 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
ATMQ13315 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
ATMQ13315 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
ATMQ13315 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
ATMQ13315 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
ATMQ13315 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
ATMQ13315 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
ATMQ13315 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
ATMQ13315 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
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