Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SEMA3FQ13275 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SEMA3FQ13275 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SEMA3FQ13275 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SEMA3FQ13275 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SEMA3FQ13275 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SEMA3FQ13275 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SEMA3FQ13275 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SEMA3FQ13275 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SEMA3FQ13275 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SEMA3FQ13275 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SEMA3FQ13275 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SEMA3FQ13275 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SEMA3FQ13275 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SEMA3FQ13275 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SEMA3FQ13275 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SEMA3FQ13275 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SEMA3FQ13275 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SEMA3FQ13275 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SEMA3FQ13275 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SEMA3FQ13275 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SEMA3FQ13275 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SEMA3FQ13275 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SEMA3FQ13275 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
SEMA3FQ13275 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SEMA3FQ13275 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SEMA3FQ13275 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SEMA3FQ13275 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SEMA3FQ13275 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SEMA3FQ13275 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SEMA3FQ13275 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SEMA3FQ13275 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SEMA3FQ13275 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SEMA3FQ13275 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
SEMA3FQ13275 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SEMA3FQ13275 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SEMA3FQ13275 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SEMA3FQ13275 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SEMA3FQ13275 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SEMA3FQ13275 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SEMA3FQ13275 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SEMA3FQ13275 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SEMA3FQ13275 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SEMA3FQ13275 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SEMA3FQ13275 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SEMA3FQ13275 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SEMA3FQ13275 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SEMA3FQ13275 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SEMA3FQ13275 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SEMA3FQ13275 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SEMA3FQ13275 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SEMA3FQ13275 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SEMA3FQ13275 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SEMA3FQ13275 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SEMA3FQ13275 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SEMA3FQ13275 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SEMA3FQ13275 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SEMA3FQ13275 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SEMA3FQ13275 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SEMA3FQ13275 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SEMA3FQ13275 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SEMA3FQ13275 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SEMA3FQ13275 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SEMA3FQ13275 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SEMA3FQ13275 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SEMA3FQ13275 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SEMA3FQ13275 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
SEMA3FQ13275 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEMA3FQ13275 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEMA3FQ13275 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEMA3FQ13275 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEMA3FQ13275 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEMA3FQ13275 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEMA3FQ13275 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEMA3FQ13275 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEMA3FQ13275 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SEMA3FQ13275 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEMA3FQ13275 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEMA3FQ13275 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEMA3FQ13275 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEMA3FQ13275 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEMA3FQ13275 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEMA3FQ13275 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEMA3FQ13275 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEMA3FQ13275 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEMA3FQ13275 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SEMA3FQ13275 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
SEMA3FQ13275 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEMA3FQ13275 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEMA3FQ13275 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEMA3FQ13275 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEMA3FQ13275 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEMA3FQ13275 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SEMA3FQ13275 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
SEMA3FQ13275 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SEMA3FQ13275 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SEMA3FQ13275 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEMA3FQ13275 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEMA3FQ13275 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEMA3FQ13275 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.9 ms