Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CALCOCO2Q13137 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CALCOCO2Q13137 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CALCOCO2Q13137 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
CALCOCO2Q13137 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CALCOCO2Q13137 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CALCOCO2Q13137 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CALCOCO2Q13137 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CALCOCO2Q13137 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CALCOCO2Q13137 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CALCOCO2Q13137 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CALCOCO2Q13137 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CALCOCO2Q13137 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CALCOCO2Q13137 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CALCOCO2Q13137 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CALCOCO2Q13137 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CALCOCO2Q13137 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
CALCOCO2Q13137 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CALCOCO2Q13137 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CALCOCO2Q13137 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
CALCOCO2Q13137 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
CALCOCO2Q13137 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CALCOCO2Q13137 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CALCOCO2Q13137 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
CALCOCO2Q13137 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
CALCOCO2Q13137 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CALCOCO2Q13137 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CALCOCO2Q13137 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CALCOCO2Q13137 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
CALCOCO2Q13137 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CALCOCO2Q13137 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CALCOCO2Q13137 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CALCOCO2Q13137 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CALCOCO2Q13137 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CALCOCO2Q13137 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CALCOCO2Q13137 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CALCOCO2Q13137 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CALCOCO2Q13137 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CALCOCO2Q13137 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CALCOCO2Q13137 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CALCOCO2Q13137 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CALCOCO2Q13137 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CALCOCO2Q13137 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CALCOCO2Q13137 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CALCOCO2Q13137 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CALCOCO2Q13137 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CALCOCO2Q13137 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CALCOCO2Q13137 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
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CALCOCO2Q13137 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CALCOCO2Q13137 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CALCOCO2Q13137 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CALCOCO2Q13137 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CALCOCO2Q13137 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CALCOCO2Q13137 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
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CALCOCO2Q13137 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
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CALCOCO2Q13137 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
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CALCOCO2Q13137 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
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CALCOCO2Q13137 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
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CALCOCO2Q13137 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
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CALCOCO2Q13137 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
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CALCOCO2Q13137 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CALCOCO2Q13137 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CALCOCO2Q13137 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CALCOCO2Q13137 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CALCOCO2Q13137 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CALCOCO2Q13137 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CALCOCO2Q13137 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CALCOCO2Q13137 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CALCOCO2Q13137 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
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