Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
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IFT88Q13099 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
IFT88Q13099 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
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IFT88Q13099 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
IFT88Q13099 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
IFT88Q13099 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
IFT88Q13099 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
IFT88Q13099 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
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IFT88Q13099 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
IFT88Q13099 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
IFT88Q13099 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
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IFT88Q13099 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
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IFT88Q13099 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.09□□□□□ -2.4
IFT88Q13099 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
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