Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
CPSF1Q10570 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
CPSF1Q10570 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
CPSF1Q10570 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
CPSF1Q10570 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
CPSF1Q10570 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
CPSF1Q10570 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
CPSF1Q10570 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
CPSF1Q10570 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
CPSF1Q10570 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
CPSF1Q10570 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
CPSF1Q10570 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
CPSF1Q10570 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
CPSF1Q10570 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
CPSF1Q10570 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
CPSF1Q10570 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
CPSF1Q10570 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
CPSF1Q10570 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
CPSF1Q10570 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
CPSF1Q10570 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
CPSF1Q10570 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
CPSF1Q10570 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
CPSF1Q10570 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC-2.15□□□□□ -2.75
CPSF1Q10570 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
CPSF1Q10570 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
CPSF1Q10570 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC-2.15□□□□□ -2.75
CPSF1Q10570 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
CPSF1Q10570 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
CPSF1Q10570 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
CPSF1Q10570 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
CPSF1Q10570 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
CPSF1Q10570 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
CPSF1Q10570 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
CPSF1Q10570 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
CPSF1Q10570 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
CPSF1Q10570 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
CPSF1Q10570 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
CPSF1Q10570 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
CPSF1Q10570 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
CPSF1Q10570 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
CPSF1Q10570 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
CPSF1Q10570 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
CPSF1Q10570 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
CPSF1Q10570 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
CPSF1Q10570 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
CPSF1Q10570 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC-2.17□□□□□ -2.76
CPSF1Q10570 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
CPSF1Q10570 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
CPSF1Q10570 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
CPSF1Q10570 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
CPSF1Q10570 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
CPSF1Q10570 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
CPSF1Q10570 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
CPSF1Q10570 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
CPSF1Q10570 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
CPSF1Q10570 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
CPSF1Q10570 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
CPSF1Q10570 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
CPSF1Q10570 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
CPSF1Q10570 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
CPSF1Q10570 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
CPSF1Q10570 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
CPSF1Q10570 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
CPSF1Q10570 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
CPSF1Q10570 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
CPSF1Q10570 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
CPSF1Q10570 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
CPSF1Q10570 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
CPSF1Q10570 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
CPSF1Q10570 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
CPSF1Q10570 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
CPSF1Q10570 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
CPSF1Q10570 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
CPSF1Q10570 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
CPSF1Q10570 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
CPSF1Q10570 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
CPSF1Q10570 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
CPSF1Q10570 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
CPSF1Q10570 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
CPSF1Q10570 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
CPSF1Q10570 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
CPSF1Q10570 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
CPSF1Q10570 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
CPSF1Q10570 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
CPSF1Q10570 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
CPSF1Q10570 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
CPSF1Q10570 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
CPSF1Q10570 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
CPSF1Q10570 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
CPSF1Q10570 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
CPSF1Q10570 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
CPSF1Q10570 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
CPSF1Q10570 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
CPSF1Q10570 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
CPSF1Q10570 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
CPSF1Q10570 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
CPSF1Q10570 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
CPSF1Q10570 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
CPSF1Q10570 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
CPSF1Q10570 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.3 ms