Protein–RNA interactions for Protein: P53611

RABGGTB, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTBP53611 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
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