Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PGGT1BP53609 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PGGT1BP53609 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PGGT1BP53609 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PGGT1BP53609 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PGGT1BP53609 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PGGT1BP53609 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PGGT1BP53609 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PGGT1BP53609 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PGGT1BP53609 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
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PGGT1BP53609 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PGGT1BP53609 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
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PGGT1BP53609 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
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PGGT1BP53609 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
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PGGT1BP53609 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PGGT1BP53609 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PGGT1BP53609 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PGGT1BP53609 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PGGT1BP53609 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.34□□□□□ -2.19
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PGGT1BP53609 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PGGT1BP53609 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PGGT1BP53609 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PGGT1BP53609 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
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PGGT1BP53609 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PGGT1BP53609 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PGGT1BP53609 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PGGT1BP53609 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PGGT1BP53609 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PGGT1BP53609 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
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