Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ATRXP46100 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ATRXP46100 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ATRXP46100 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ATRXP46100 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ATRXP46100 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ATRXP46100 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ATRXP46100 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ATRXP46100 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ATRXP46100 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ATRXP46100 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ATRXP46100 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ATRXP46100 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ATRXP46100 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ATRXP46100 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ATRXP46100 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATRXP46100 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATRXP46100 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATRXP46100 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATRXP46100 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATRXP46100 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATRXP46100 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATRXP46100 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATRXP46100 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATRXP46100 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATRXP46100 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATRXP46100 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATRXP46100 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATRXP46100 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATRXP46100 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATRXP46100 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATRXP46100 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATRXP46100 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATRXP46100 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATRXP46100 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATRXP46100 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATRXP46100 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATRXP46100 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATRXP46100 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATRXP46100 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATRXP46100 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATRXP46100 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATRXP46100 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATRXP46100 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATRXP46100 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
ATRXP46100 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATRXP46100 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATRXP46100 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATRXP46100 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATRXP46100 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATRXP46100 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATRXP46100 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATRXP46100 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATRXP46100 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATRXP46100 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATRXP46100 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ATRXP46100 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ATRXP46100 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ATRXP46100 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ATRXP46100 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ATRXP46100 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ATRXP46100 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ATRXP46100 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ATRXP46100 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ATRXP46100 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ATRXP46100 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ATRXP46100 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ATRXP46100 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ATRXP46100 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ATRXP46100 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ATRXP46100 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ATRXP46100 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ATRXP46100 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ATRXP46100 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ATRXP46100 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ATRXP46100 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
ATRXP46100 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ATRXP46100 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ATRXP46100 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ATRXP46100 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ATRXP46100 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ATRXP46100 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ATRXP46100 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ATRXP46100 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ATRXP46100 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ATRXP46100 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ATRXP46100 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ATRXP46100 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ATRXP46100 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ATRXP46100 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ATRXP46100 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ATRXP46100 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ATRXP46100 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ATRXP46100 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ATRXP46100 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ATRXP46100 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ATRXP46100 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ATRXP46100 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ATRXP46100 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ATRXP46100 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.8 ms