Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.47□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.42□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.42□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
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