Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
USP18Q9UMW8 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
USP18Q9UMW8 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
USP18Q9UMW8 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
USP18Q9UMW8 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.8□□□□□ -2.12
USP18Q9UMW8 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
USP18Q9UMW8 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
USP18Q9UMW8 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
USP18Q9UMW8 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
USP18Q9UMW8 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
USP18Q9UMW8 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
USP18Q9UMW8 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
USP18Q9UMW8 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
USP18Q9UMW8 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
USP18Q9UMW8 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
USP18Q9UMW8 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
USP18Q9UMW8 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
USP18Q9UMW8 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
USP18Q9UMW8 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
USP18Q9UMW8 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
USP18Q9UMW8 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
USP18Q9UMW8 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
USP18Q9UMW8 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
USP18Q9UMW8 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
USP18Q9UMW8 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
USP18Q9UMW8 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
USP18Q9UMW8 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
USP18Q9UMW8 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
USP18Q9UMW8 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
USP18Q9UMW8 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
USP18Q9UMW8 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
USP18Q9UMW8 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
USP18Q9UMW8 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
USP18Q9UMW8 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
USP18Q9UMW8 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
USP18Q9UMW8 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
USP18Q9UMW8 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
USP18Q9UMW8 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
USP18Q9UMW8 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
USP18Q9UMW8 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
USP18Q9UMW8 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
USP18Q9UMW8 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.77□□□□□ -2.13
USP18Q9UMW8 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
USP18Q9UMW8 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
USP18Q9UMW8 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
USP18Q9UMW8 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
USP18Q9UMW8 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
USP18Q9UMW8 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
USP18Q9UMW8 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
USP18Q9UMW8 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
USP18Q9UMW8 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
USP18Q9UMW8 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
USP18Q9UMW8 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
USP18Q9UMW8 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
USP18Q9UMW8 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
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USP18Q9UMW8 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
USP18Q9UMW8 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
USP18Q9UMW8 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
USP18Q9UMW8 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
USP18Q9UMW8 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
USP18Q9UMW8 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
USP18Q9UMW8 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
USP18Q9UMW8 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
USP18Q9UMW8 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
USP18Q9UMW8 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
USP18Q9UMW8 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
USP18Q9UMW8 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
USP18Q9UMW8 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
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USP18Q9UMW8 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
USP18Q9UMW8 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
USP18Q9UMW8 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
USP18Q9UMW8 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
USP18Q9UMW8 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
USP18Q9UMW8 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
USP18Q9UMW8 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
USP18Q9UMW8 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
USP18Q9UMW8 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
USP18Q9UMW8 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
USP18Q9UMW8 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
USP18Q9UMW8 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
USP18Q9UMW8 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
USP18Q9UMW8 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
USP18Q9UMW8 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
USP18Q9UMW8 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
USP18Q9UMW8 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
USP18Q9UMW8 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
USP18Q9UMW8 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
USP18Q9UMW8 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
USP18Q9UMW8 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
USP18Q9UMW8 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
USP18Q9UMW8 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
USP18Q9UMW8 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
USP18Q9UMW8 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
USP18Q9UMW8 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
USP18Q9UMW8 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
USP18Q9UMW8 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
USP18Q9UMW8 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
USP18Q9UMW8 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
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