Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
EHD3Q9NZN3 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
EHD3Q9NZN3 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
EHD3Q9NZN3 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
EHD3Q9NZN3 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
EHD3Q9NZN3 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
EHD3Q9NZN3 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
EHD3Q9NZN3 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
EHD3Q9NZN3 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
EHD3Q9NZN3 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
EHD3Q9NZN3 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
EHD3Q9NZN3 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
EHD3Q9NZN3 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
EHD3Q9NZN3 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
EHD3Q9NZN3 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
EHD3Q9NZN3 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
EHD3Q9NZN3 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
EHD3Q9NZN3 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
EHD3Q9NZN3 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
EHD3Q9NZN3 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
EHD3Q9NZN3 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
EHD3Q9NZN3 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
EHD3Q9NZN3 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
EHD3Q9NZN3 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
EHD3Q9NZN3 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
EHD3Q9NZN3 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
EHD3Q9NZN3 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
EHD3Q9NZN3 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
EHD3Q9NZN3 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
EHD3Q9NZN3 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
EHD3Q9NZN3 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
EHD3Q9NZN3 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
EHD3Q9NZN3 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
EHD3Q9NZN3 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
EHD3Q9NZN3 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
EHD3Q9NZN3 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
EHD3Q9NZN3 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
EHD3Q9NZN3 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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