Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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